La structure principale est donc un cube géant composé de petits cubes qui sont les pièces.
Chaque côté de la structure cubique à 26 éléments, en largeur, en longueur et en hauteur ce qui fait un total de pièces de 26x26x26 = 17576 (c'est pas peu!)
L'enceinte (le sarcophage comme dit l'architecte il me semble) laisse un espace vide de la taille d'une pièce, et dans le film on comprend qu'une pièce spéciale comprend l'unique porte d'entrée-sortie, on a donc 17576+1 pièces en réalité.
Chaque pièce a un ensemble de trois nombres pour l'identifier et aussi pour prévoir son mouvement.
Oui je ne suis pas d'accord avec la théorie que seule la pièce additionnelle bouge, la mathématicienne le dit d'ailleurs, tout est en mouvement et elle l'explique avec la permutation des chiffres pour prévoir le mouvement de la pièce (mais j'y reviendrai plus tard).
Donc d'abord, tout ce truc c'est un cadenas géant qui est ouvert uniquement en position initiale, quand la pièce-passerelle est alignée avec la sortie, dès qu'il y a un mouvement, ça se verrouille et il faudra attendre que ça revienne à sa position initiale pour pouvoir en sortir.
Les nombres permettent trois choses : connaître la position initiale d'une pièce, savoir quels mouvements elle fera dans les trois directions et savoir si elle est piégée.
Connaître la position de la pièce :
Il faut additionner les chiffres de chaque combinaison de nombres pour obtenir les coordonnées dans un repère x,y,z
Exemple : 123 456 789
1+2+3 --> 6 (x)
4+5+6 --> 15 (y)
7+8+9 --> 24 (z)
Cette pièce se trouve initialement en 6ème position sur la longueur, sur la 15ème position sur la largeur et au 24ème étage sur la hauteur.
A un moment dans le film, elle bloque sur une coordonnée impossible pour elle : 27, qui ferait sortir la pièce du cube, et elle a raison car les nombres à 3 chiffres vont jusqu'à 999, donc ça donne une coordonnée de 9+9+9=27, ce qui dépasse des 26 pièces...c'est donc ensuite qu'elle comprend que c'est une pièce spéciale qui est une passerelle entre le cube et l'extérieur !
Connaître le mouvement de la pièce :
Elle dit que pour le mouvement elle doit soustraire les chiffres un à un (d'ailleurs énorme erreur dans la VF "il faut diviser les chiffres entre eux" , ce qui n'a aucun sens, je suis passé en VO et c'est bien "substract" qu'elle dit, honteux de ne pas réussir à traduire un truc aussi important dans la logique du film 
)
Donc pour connaître le mouvement il faut faire la différence des chiffres un à un :
123 456 789
x : 1-2 ; 2-3 ; 3-1 --> -1 ; -1; 2
Donc la pièce se déplace sur la longueur d'une case en arrière, puis d'une case en arrière, puis de deux cases en avant --> on est bien revenu à sa position initiale !
Et ce pour y et z aussi, donc on comprend que chaque pièce à 3 mouvement dans chaque direction avant de revenir à l'origine.
A noter que pour la passerelle, elle ne se déplace que dans deux directions et reste donc sur un plan parallèle au cube car l'un de ses 3 nombres est 999 (puisqu'elle est hors cube, elle a une coordonnée à 27=9+9+9)
--> 9-9 ; 9-9 ; 9-9 --> 0 ; 0 ; 0
Elle ne bouge pas pour l'axe considéré.
La seule inconnue là-dedans c'est le temps, quand est-ce que ça bouge ? Les mouvements x, y et z se font-ils en même temps ? Y'a jamais de choc entre les pièces ?
A cela s'ajoute un truc plus complexe et je ne suis pas sûr d'avoir bien compris...
Une pièce est piégée ou pas :
Au départ elle croit que si un des 3 nombres est premier, c'est piégé.
Un nombres premier est divisible par 1 et lui-même seulement (2 , 3 , 5 , 7 , 11 , ...le sont, 4, 6, 8, 9 ne le sont pas)
Mais elle comprend, une fois que le mec qui jette les chaussures se fait bouffer le visage par le gaz là, que c'est faux...et là la théorie est plus bizarre... j'ai noté les nombres donnés dans le film et voici ce que je pense.
Si un nombre, une fois décomposé en facteurs premiers, a un de ses facteurs premiers qui a une puissance, la pièce est piégée.
Après c'est pas très clair entre ce qu'elle dit et ce que l'autiste dit...il dit juste 3, 2, 2, 1, etc...
Elle lui demande pour voir si elle peut se fier à lui :
30 il répond 3, ok 30 = 3x2x5 on a bien 3 facteurs premiers
7 il répond 1, ok 7 = 1x7 on a bien 1 facteur premier (1 ne compte pas)
Par la suite elle dit 898 il répond 2
Ok 898 = 2x449 (ils sont premiers tous les deux)
Sauf qu'après pour 384 il répond 1 et ils en déduisent que c'est piégé. Sauf que 384 n'a pas un seul facteur premier dans sa décomposition :
384 = 2⁷ x 3
Ce qui me fait dire que si un des facteurs premiers de la décomposition a une puissance, la pièce est piégée. Elle dit un moment "c'est la puissance des nombres qui dit si il y a piège" donc ça me conforte dans cette idée!
Et donc quand l'autiste dit "1" ça serait pour "ce nombre dans sa décomposition, a un seul chiffre/nombre premier qui n'a pas de puissance"
Dans ce cas
384 = 2 x 2 x 2 x 2 x 2 x 2 x 2 x 3 pas bon puisque seulement 3 n'a pas de puissance
55 = 5 x 11 bon puisque ni 5 ni 11 n'ont de puissance
