À mon sens, ça ne peut pas s'éviter à 100% puisque l'écrit conduit dans certains contextes aux quiproquos pour les raisons évoquées dans le post initial (on a pas la personne en face et on manque donc des données essentielles comme l'intonation, le regard, etc., qui en disent souvent beaucoup plus que les mots en eux-mêmes), les meilleures attitudes à adopter sont :
la prise de recul : ne pas tout prendre au premier degré et prendre la mouche et considérer que les informations manquantes jouent beaucoup sur notre interprétation au détriment de l'intention de l'émetteur.
la communication : communiquer encore plus et en expliquant ce que l'on voulait vraiment dire sans se fâcher et en prenant la peine d'écouter l'autre, c'est la clef ! Il m'est arrivé un nombre incalculable de fois quand j'étais moi-même pas en forme ou de mauvaise humeur de mésinterpréter le sens de certains propos et de partir au quart de tour au lieu de prendre le temps de simplement dire à mon interlocuteur : "écoute j'ai compris x et je l'ai pas bien pris alors qu'apparemment c'était y que tu voulais dire". Franchement, ça change la vie juste quand on prend de s'écouter mutuellement, l'écrit en devient tout de suite moins compliqué.
Favoriser les échanges vocaux quand on ne peut pas voir la personne régulièrement IRL. Rien que d'entendre la voix, ça donne une toute autre dimension et ça permet de relativiser pas mal de choses et éviter de nombreux écueils.